Divenne la parrocchiale nel 1628, dopo una lunga pratica legale che chiamò in causa gli abitanti del borgo, il Prevosto della Collegiata di S. Lorenzo e le autorità ecclesiastiche della Diocesi di Como. Un interessante documento, datato 27 aprile 1628, ci ha fatto conoscere alcuni particolari della vita religiosa della valle. In quel tempo gli abitanti di Cavona fecero una petizione per ottenere che la cappella rurale di S. Michele fosse eretta a parrocchia con la presenza continua di un curato per il quale mettevano a disposizione una casa e dei beni annessi alla Cappella. Chiedevano in tal modo la separazione dalla Chiesa pievana della Canonica. A motivare la loro richiesta, i fedeli di Cavona adducevano l'impossibilità di oltrepassare a piedi e a cavallo il fiume Scavè che, dopo un periodo di piogge, inondava le terre. Il prevosto comunicò alla Curia Diocesana il suo parere sfavorevole, accusando di falso il Console Botta, Sindaco del paese: a suo dire, lo Scavè era un torrente che non inondava e la popolazione non aveva avuto un aumento rilevante rispetto al passato.
